Lấy bối cảnh Nhật Bản bị chia cắt thành 3 vùng lãnh thổ bởi bức tường khổng lồ Skywall. Câu chuyện xoay quanh Kiryu Sento, một thiên tài vật lý mất trí nhớ, người chiến đấu để khám phá quá khứ, ngăn chặn tổ chức độc ác Faust và cứu nhân loại khỏi thực thể ngoài hành tinh.